Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nova1Q9JKN6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nova1Q9JKN6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nova1Q9JKN6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nova1Q9JKN6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nova1Q9JKN6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nova1Q9JKN6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nova1Q9JKN6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nova1Q9JKN6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nova1Q9JKN6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nova1Q9JKN6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nova1Q9JKN6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nova1Q9JKN6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nova1Q9JKN6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nova1Q9JKN6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nova1Q9JKN6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nova1Q9JKN6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nova1Q9JKN6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nova1Q9JKN6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nova1Q9JKN6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nova1Q9JKN6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nova1Q9JKN6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nova1Q9JKN6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nova1Q9JKN6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nova1Q9JKN6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nova1Q9JKN6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nova1Q9JKN6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nova1Q9JKN6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nova1Q9JKN6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nova1Q9JKN6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nova1Q9JKN6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nova1Q9JKN6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nova1Q9JKN6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nova1Q9JKN6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nova1Q9JKN6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nova1Q9JKN6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nova1Q9JKN6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nova1Q9JKN6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nova1Q9JKN6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nova1Q9JKN6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nova1Q9JKN6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nova1Q9JKN6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nova1Q9JKN6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nova1Q9JKN6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nova1Q9JKN6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nova1Q9JKN6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nova1Q9JKN6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nova1Q9JKN6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nova1Q9JKN6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nova1Q9JKN6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nova1Q9JKN6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms