Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tuba8Q9JJZ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tuba8Q9JJZ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tuba8Q9JJZ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tuba8Q9JJZ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tuba8Q9JJZ2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tuba8Q9JJZ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tuba8Q9JJZ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tuba8Q9JJZ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tuba8Q9JJZ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tuba8Q9JJZ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tuba8Q9JJZ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tuba8Q9JJZ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tuba8Q9JJZ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tuba8Q9JJZ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tuba8Q9JJZ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tuba8Q9JJZ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tuba8Q9JJZ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tuba8Q9JJZ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tuba8Q9JJZ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tuba8Q9JJZ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tuba8Q9JJZ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tuba8Q9JJZ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tuba8Q9JJZ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tuba8Q9JJZ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tuba8Q9JJZ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tuba8Q9JJZ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tuba8Q9JJZ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tuba8Q9JJZ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tuba8Q9JJZ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tuba8Q9JJZ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tuba8Q9JJZ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tuba8Q9JJZ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tuba8Q9JJZ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tuba8Q9JJZ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tuba8Q9JJZ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tuba8Q9JJZ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tuba8Q9JJZ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tuba8Q9JJZ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tuba8Q9JJZ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tuba8Q9JJZ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tuba8Q9JJZ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tuba8Q9JJZ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tuba8Q9JJZ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tuba8Q9JJZ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tuba8Q9JJZ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tuba8Q9JJZ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tuba8Q9JJZ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms