Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ascl3Q9JJR7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ascl3Q9JJR7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ascl3Q9JJR7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ascl3Q9JJR7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ascl3Q9JJR7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ascl3Q9JJR7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ascl3Q9JJR7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ascl3Q9JJR7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ascl3Q9JJR7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ascl3Q9JJR7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ascl3Q9JJR7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ascl3Q9JJR7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ascl3Q9JJR7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ascl3Q9JJR7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ascl3Q9JJR7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ascl3Q9JJR7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ascl3Q9JJR7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ascl3Q9JJR7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ascl3Q9JJR7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ascl3Q9JJR7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ascl3Q9JJR7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ascl3Q9JJR7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ascl3Q9JJR7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ascl3Q9JJR7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ascl3Q9JJR7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ascl3Q9JJR7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ascl3Q9JJR7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ascl3Q9JJR7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ascl3Q9JJR7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ascl3Q9JJR7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ascl3Q9JJR7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ascl3Q9JJR7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ascl3Q9JJR7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ascl3Q9JJR7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ascl3Q9JJR7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ascl3Q9JJR7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ascl3Q9JJR7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ascl3Q9JJR7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ascl3Q9JJR7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ascl3Q9JJR7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ascl3Q9JJR7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ascl3Q9JJR7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ascl3Q9JJR7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ascl3Q9JJR7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ascl3Q9JJR7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ascl3Q9JJR7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ascl3Q9JJR7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ascl3Q9JJR7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ascl3Q9JJR7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ascl3Q9JJR7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ascl3Q9JJR7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ascl3Q9JJR7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ascl3Q9JJR7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ascl3Q9JJR7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ascl3Q9JJR7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ascl3Q9JJR7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ascl3Q9JJR7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ascl3Q9JJR7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ascl3Q9JJR7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ascl3Q9JJR7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ascl3Q9JJR7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ascl3Q9JJR7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ascl3Q9JJR7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ascl3Q9JJR7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ascl3Q9JJR7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ascl3Q9JJR7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ascl3Q9JJR7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ascl3Q9JJR7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ascl3Q9JJR7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ascl3Q9JJR7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ascl3Q9JJR7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ascl3Q9JJR7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ascl3Q9JJR7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ascl3Q9JJR7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms