Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim39Q9ESN2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim39Q9ESN2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim39Q9ESN2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim39Q9ESN2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim39Q9ESN2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim39Q9ESN2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim39Q9ESN2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim39Q9ESN2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim39Q9ESN2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim39Q9ESN2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim39Q9ESN2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim39Q9ESN2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim39Q9ESN2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim39Q9ESN2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim39Q9ESN2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim39Q9ESN2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim39Q9ESN2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim39Q9ESN2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim39Q9ESN2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim39Q9ESN2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim39Q9ESN2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim39Q9ESN2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim39Q9ESN2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim39Q9ESN2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim39Q9ESN2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim39Q9ESN2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim39Q9ESN2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim39Q9ESN2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim39Q9ESN2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim39Q9ESN2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim39Q9ESN2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim39Q9ESN2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim39Q9ESN2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim39Q9ESN2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim39Q9ESN2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim39Q9ESN2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim39Q9ESN2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim39Q9ESN2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms