Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700012A03RikQ9DAF1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700012A03RikQ9DAF1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700012A03RikQ9DAF1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700012A03RikQ9DAF1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700012A03RikQ9DAF1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700012A03RikQ9DAF1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700012A03RikQ9DAF1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700012A03RikQ9DAF1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms