Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabra4Q9D6F4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabra4Q9D6F4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabra4Q9D6F4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra4Q9D6F4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra4Q9D6F4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra4Q9D6F4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra4Q9D6F4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabra4Q9D6F4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabra4Q9D6F4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabra4Q9D6F4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabra4Q9D6F4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabra4Q9D6F4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabra4Q9D6F4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra4Q9D6F4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra4Q9D6F4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra4Q9D6F4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra4Q9D6F4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra4Q9D6F4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra4Q9D6F4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra4Q9D6F4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabra4Q9D6F4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabra4Q9D6F4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabra4Q9D6F4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gabra4Q9D6F4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gabra4Q9D6F4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabra4Q9D6F4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabra4Q9D6F4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabra4Q9D6F4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabra4Q9D6F4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabra4Q9D6F4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabra4Q9D6F4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabra4Q9D6F4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabra4Q9D6F4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabra4Q9D6F4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabra4Q9D6F4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.6 ms