Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
Spata1Q9D5R4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Spata1Q9D5R4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Spata1Q9D5R4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Spata1Q9D5R4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Spata1Q9D5R4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Spata1Q9D5R4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Spata1Q9D5R4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Spata1Q9D5R4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Spata1Q9D5R4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Spata1Q9D5R4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Spata1Q9D5R4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Spata1Q9D5R4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Spata1Q9D5R4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Spata1Q9D5R4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,5■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Spata1Q9D5R4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Spata1Q9D5R4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
Spata1Q9D5R4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Spata1Q9D5R4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Spata1Q9D5R4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Spata1Q9D5R4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Spata1Q9D5R4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Spata1Q9D5R4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Spata1Q9D5R4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Spata1Q9D5R4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,39■■□□□ 1,5
Spata1Q9D5R4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Spata1Q9D5R4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Spata1Q9D5R4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Spata1Q9D5R4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Spata1Q9D5R4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Spata1Q9D5R4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Spata1Q9D5R4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,32■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Spata1Q9D5R4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Spata1Q9D5R4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Spata1Q9D5R4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Spata1Q9D5R4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Spata1Q9D5R4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Spata1Q9D5R4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Spata1Q9D5R4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Spata1Q9D5R4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Spata1Q9D5R4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Spata1Q9D5R4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Spata1Q9D5R4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Spata1Q9D5R4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Spata1Q9D5R4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Spata1Q9D5R4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Spata1Q9D5R4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Spata1Q9D5R4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Spata1Q9D5R4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Spata1Q9D5R4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Spata1Q9D5R4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Spata1Q9D5R4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Spata1Q9D5R4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Spata1Q9D5R4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Spata1Q9D5R4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24,14■■□□□ 1,45
Spata1Q9D5R4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Spata1Q9D5R4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Spata1Q9D5R4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Spata1Q9D5R4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Spata1Q9D5R4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Spata1Q9D5R4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24,13■■□□□ 1,45
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