Protein–RNA interactions for Protein: Q9D416

Arl13a, ADP-ribosylation factor-like protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13aQ9D416 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arl13aQ9D416 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Arl13aQ9D416 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arl13aQ9D416 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arl13aQ9D416 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arl13aQ9D416 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arl13aQ9D416 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arl13aQ9D416 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arl13aQ9D416 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arl13aQ9D416 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arl13aQ9D416 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arl13aQ9D416 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arl13aQ9D416 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arl13aQ9D416 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arl13aQ9D416 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arl13aQ9D416 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arl13aQ9D416 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Arl13aQ9D416 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arl13aQ9D416 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arl13aQ9D416 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arl13aQ9D416 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arl13aQ9D416 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arl13aQ9D416 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arl13aQ9D416 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arl13aQ9D416 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arl13aQ9D416 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arl13aQ9D416 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Arl13aQ9D416 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arl13aQ9D416 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arl13aQ9D416 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Arl13aQ9D416 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arl13aQ9D416 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Arl13aQ9D416 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arl13aQ9D416 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arl13aQ9D416 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arl13aQ9D416 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arl13aQ9D416 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arl13aQ9D416 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arl13aQ9D416 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arl13aQ9D416 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arl13aQ9D416 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arl13aQ9D416 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arl13aQ9D416 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arl13aQ9D416 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arl13aQ9D416 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arl13aQ9D416 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Arl13aQ9D416 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arl13aQ9D416 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arl13aQ9D416 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arl13aQ9D416 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arl13aQ9D416 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arl13aQ9D416 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arl13aQ9D416 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arl13aQ9D416 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arl13aQ9D416 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arl13aQ9D416 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arl13aQ9D416 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arl13aQ9D416 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arl13aQ9D416 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Arl13aQ9D416 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arl13aQ9D416 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl13aQ9D416 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arl13aQ9D416 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arl13aQ9D416 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arl13aQ9D416 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arl13aQ9D416 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arl13aQ9D416 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arl13aQ9D416 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arl13aQ9D416 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arl13aQ9D416 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arl13aQ9D416 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms