Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H9

Mfap4, Microfibril-associated glycoprotein 4, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap4Q9D1H9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap4Q9D1H9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfap4Q9D1H9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfap4Q9D1H9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfap4Q9D1H9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mfap4Q9D1H9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfap4Q9D1H9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfap4Q9D1H9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfap4Q9D1H9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfap4Q9D1H9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfap4Q9D1H9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfap4Q9D1H9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfap4Q9D1H9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfap4Q9D1H9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfap4Q9D1H9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mfap4Q9D1H9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mfap4Q9D1H9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms