Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Exo5Q9CXP9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Exo5Q9CXP9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exo5Q9CXP9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exo5Q9CXP9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exo5Q9CXP9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exo5Q9CXP9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Exo5Q9CXP9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exo5Q9CXP9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exo5Q9CXP9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exo5Q9CXP9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Exo5Q9CXP9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exo5Q9CXP9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exo5Q9CXP9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Exo5Q9CXP9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Exo5Q9CXP9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Exo5Q9CXP9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Exo5Q9CXP9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Exo5Q9CXP9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Exo5Q9CXP9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Exo5Q9CXP9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Exo5Q9CXP9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Exo5Q9CXP9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Exo5Q9CXP9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Exo5Q9CXP9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Exo5Q9CXP9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms