Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cxxc1Q9CWW7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cxxc1Q9CWW7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cxxc1Q9CWW7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cxxc1Q9CWW7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cxxc1Q9CWW7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cxxc1Q9CWW7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cxxc1Q9CWW7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cxxc1Q9CWW7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cxxc1Q9CWW7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cxxc1Q9CWW7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cxxc1Q9CWW7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cxxc1Q9CWW7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cxxc1Q9CWW7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cxxc1Q9CWW7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cxxc1Q9CWW7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cxxc1Q9CWW7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cxxc1Q9CWW7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cxxc1Q9CWW7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cxxc1Q9CWW7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cxxc1Q9CWW7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cxxc1Q9CWW7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cxxc1Q9CWW7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cxxc1Q9CWW7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cxxc1Q9CWW7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cxxc1Q9CWW7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cxxc1Q9CWW7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cxxc1Q9CWW7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxxc1Q9CWW7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxxc1Q9CWW7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxxc1Q9CWW7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxxc1Q9CWW7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxxc1Q9CWW7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxxc1Q9CWW7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxxc1Q9CWW7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxxc1Q9CWW7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cxxc1Q9CWW7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cxxc1Q9CWW7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxxc1Q9CWW7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxxc1Q9CWW7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxxc1Q9CWW7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cxxc1Q9CWW7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cxxc1Q9CWW7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxxc1Q9CWW7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxxc1Q9CWW7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cxxc1Q9CWW7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxxc1Q9CWW7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxxc1Q9CWW7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cxxc1Q9CWW7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxxc1Q9CWW7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxxc1Q9CWW7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cxxc1Q9CWW7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cxxc1Q9CWW7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cxxc1Q9CWW7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxxc1Q9CWW7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxxc1Q9CWW7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cxxc1Q9CWW7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxxc1Q9CWW7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cxxc1Q9CWW7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cxxc1Q9CWW7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cxxc1Q9CWW7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cxxc1Q9CWW7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms