Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CactinQ9CS00 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CactinQ9CS00 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CactinQ9CS00 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CactinQ9CS00 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CactinQ9CS00 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CactinQ9CS00 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CactinQ9CS00 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CactinQ9CS00 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CactinQ9CS00 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CactinQ9CS00 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CactinQ9CS00 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CactinQ9CS00 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CactinQ9CS00 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CactinQ9CS00 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CactinQ9CS00 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CactinQ9CS00 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CactinQ9CS00 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CactinQ9CS00 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CactinQ9CS00 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CactinQ9CS00 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CactinQ9CS00 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CactinQ9CS00 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CactinQ9CS00 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CactinQ9CS00 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CactinQ9CS00 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CactinQ9CS00 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CactinQ9CS00 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CactinQ9CS00 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CactinQ9CS00 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CactinQ9CS00 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CactinQ9CS00 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CactinQ9CS00 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CactinQ9CS00 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CactinQ9CS00 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CactinQ9CS00 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CactinQ9CS00 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CactinQ9CS00 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CactinQ9CS00 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CactinQ9CS00 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CactinQ9CS00 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CactinQ9CS00 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CactinQ9CS00 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CactinQ9CS00 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CactinQ9CS00 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CactinQ9CS00 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CactinQ9CS00 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CactinQ9CS00 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CactinQ9CS00 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CactinQ9CS00 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CactinQ9CS00 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CactinQ9CS00 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CactinQ9CS00 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CactinQ9CS00 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CactinQ9CS00 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CactinQ9CS00 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CactinQ9CS00 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CactinQ9CS00 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CactinQ9CS00 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CactinQ9CS00 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CactinQ9CS00 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CactinQ9CS00 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CactinQ9CS00 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CactinQ9CS00 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CactinQ9CS00 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms