Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Gadd45gip1Q9CR59 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Gadd45gip1Q9CR59 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
Gadd45gip1Q9CR59 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Gadd45gip1Q9CR59 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Gadd45gip1Q9CR59 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Gadd45gip1Q9CR59 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Gadd45gip1Q9CR59 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Gadd45gip1Q9CR59 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Gadd45gip1Q9CR59 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Gadd45gip1Q9CR59 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gadd45gip1Q9CR59 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gadd45gip1Q9CR59 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gadd45gip1Q9CR59 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Gadd45gip1Q9CR59 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Gadd45gip1Q9CR59 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Gadd45gip1Q9CR59 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Gadd45gip1Q9CR59 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Gadd45gip1Q9CR59 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Gadd45gip1Q9CR59 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Gadd45gip1Q9CR59 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Gadd45gip1Q9CR59 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Gadd45gip1Q9CR59 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Gadd45gip1Q9CR59 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Gadd45gip1Q9CR59 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Gadd45gip1Q9CR59 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Gadd45gip1Q9CR59 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Gadd45gip1Q9CR59 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Gadd45gip1Q9CR59 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Gadd45gip1Q9CR59 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Gadd45gip1Q9CR59 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Gadd45gip1Q9CR59 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Gadd45gip1Q9CR59 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gadd45gip1Q9CR59 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gadd45gip1Q9CR59 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gadd45gip1Q9CR59 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gadd45gip1Q9CR59 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Gadd45gip1Q9CR59 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Gadd45gip1Q9CR59 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Gadd45gip1Q9CR59 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gadd45gip1Q9CR59 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gadd45gip1Q9CR59 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Gadd45gip1Q9CR59 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gadd45gip1Q9CR59 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Gadd45gip1Q9CR59 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gadd45gip1Q9CR59 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gadd45gip1Q9CR59 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gadd45gip1Q9CR59 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gadd45gip1Q9CR59 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gadd45gip1Q9CR59 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gadd45gip1Q9CR59 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gadd45gip1Q9CR59 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gadd45gip1Q9CR59 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gadd45gip1Q9CR59 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,1 ms