Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc43Q9CR29 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc43Q9CR29 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc43Q9CR29 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc43Q9CR29 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc43Q9CR29 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc43Q9CR29 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc43Q9CR29 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc43Q9CR29 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc43Q9CR29 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc43Q9CR29 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc43Q9CR29 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc43Q9CR29 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc43Q9CR29 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc43Q9CR29 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc43Q9CR29 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc43Q9CR29 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc43Q9CR29 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc43Q9CR29 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc43Q9CR29 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc43Q9CR29 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc43Q9CR29 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc43Q9CR29 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc43Q9CR29 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc43Q9CR29 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc43Q9CR29 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc43Q9CR29 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc43Q9CR29 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc43Q9CR29 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc43Q9CR29 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc43Q9CR29 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc43Q9CR29 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc43Q9CR29 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc43Q9CR29 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc43Q9CR29 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc43Q9CR29 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc43Q9CR29 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc43Q9CR29 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc43Q9CR29 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc43Q9CR29 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc43Q9CR29 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc43Q9CR29 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc43Q9CR29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc43Q9CR29 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc43Q9CR29 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc43Q9CR29 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc43Q9CR29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc43Q9CR29 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc43Q9CR29 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc43Q9CR29 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc43Q9CR29 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc43Q9CR29 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc43Q9CR29 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc43Q9CR29 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc43Q9CR29 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc43Q9CR29 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc43Q9CR29 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc43Q9CR29 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc43Q9CR29 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms