Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp1b2Q9CQD4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp1b2Q9CQD4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp1b2Q9CQD4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp1b2Q9CQD4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp1b2Q9CQD4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp1b2Q9CQD4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp1b2Q9CQD4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp1b2Q9CQD4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp1b2Q9CQD4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp1b2Q9CQD4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp1b2Q9CQD4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp1b2Q9CQD4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp1b2Q9CQD4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp1b2Q9CQD4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp1b2Q9CQD4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp1b2Q9CQD4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp1b2Q9CQD4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp1b2Q9CQD4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp1b2Q9CQD4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp1b2Q9CQD4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp1b2Q9CQD4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp1b2Q9CQD4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp1b2Q9CQD4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp1b2Q9CQD4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp1b2Q9CQD4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp1b2Q9CQD4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp1b2Q9CQD4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp1b2Q9CQD4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp1b2Q9CQD4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp1b2Q9CQD4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp1b2Q9CQD4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp1b2Q9CQD4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms