Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpd52l3Q9CQ14 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpd52l3Q9CQ14 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpd52l3Q9CQ14 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpd52l3Q9CQ14 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpd52l3Q9CQ14 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpd52l3Q9CQ14 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpd52l3Q9CQ14 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpd52l3Q9CQ14 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpd52l3Q9CQ14 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpd52l3Q9CQ14 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpd52l3Q9CQ14 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpd52l3Q9CQ14 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpd52l3Q9CQ14 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpd52l3Q9CQ14 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpd52l3Q9CQ14 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpd52l3Q9CQ14 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpd52l3Q9CQ14 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpd52l3Q9CQ14 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpd52l3Q9CQ14 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpd52l3Q9CQ14 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpd52l3Q9CQ14 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpd52l3Q9CQ14 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpd52l3Q9CQ14 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpd52l3Q9CQ14 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpd52l3Q9CQ14 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpd52l3Q9CQ14 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpd52l3Q9CQ14 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpd52l3Q9CQ14 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpd52l3Q9CQ14 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpd52l3Q9CQ14 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpd52l3Q9CQ14 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpd52l3Q9CQ14 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpd52l3Q9CQ14 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpd52l3Q9CQ14 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpd52l3Q9CQ14 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpd52l3Q9CQ14 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpd52l3Q9CQ14 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpd52l3Q9CQ14 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpd52l3Q9CQ14 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpd52l3Q9CQ14 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpd52l3Q9CQ14 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms