Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ubxn2aQ99KJ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ubxn2aQ99KJ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ubxn2aQ99KJ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ubxn2aQ99KJ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ubxn2aQ99KJ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ubxn2aQ99KJ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ubxn2aQ99KJ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ubxn2aQ99KJ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ubxn2aQ99KJ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ubxn2aQ99KJ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ubxn2aQ99KJ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ubxn2aQ99KJ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ubxn2aQ99KJ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ubxn2aQ99KJ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ubxn2aQ99KJ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ubxn2aQ99KJ0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ubxn2aQ99KJ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ubxn2aQ99KJ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Ubxn2aQ99KJ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ubxn2aQ99KJ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ubxn2aQ99KJ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ubxn2aQ99KJ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ubxn2aQ99KJ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ubxn2aQ99KJ0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ubxn2aQ99KJ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ubxn2aQ99KJ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ubxn2aQ99KJ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Ubxn2aQ99KJ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ubxn2aQ99KJ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ubxn2aQ99KJ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ubxn2aQ99KJ0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ubxn2aQ99KJ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ubxn2aQ99KJ0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ubxn2aQ99KJ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ubxn2aQ99KJ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ubxn2aQ99KJ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ubxn2aQ99KJ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ubxn2aQ99KJ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubxn2aQ99KJ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubxn2aQ99KJ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubxn2aQ99KJ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ubxn2aQ99KJ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ubxn2aQ99KJ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ubxn2aQ99KJ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ubxn2aQ99KJ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ubxn2aQ99KJ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ubxn2aQ99KJ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ubxn2aQ99KJ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ubxn2aQ99KJ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ubxn2aQ99KJ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ubxn2aQ99KJ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ubxn2aQ99KJ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ubxn2aQ99KJ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ubxn2aQ99KJ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ubxn2aQ99KJ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 803.1 ms