Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufsp2Q99K23 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufsp2Q99K23 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufsp2Q99K23 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufsp2Q99K23 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufsp2Q99K23 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufsp2Q99K23 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ufsp2Q99K23 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufsp2Q99K23 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufsp2Q99K23 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufsp2Q99K23 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ufsp2Q99K23 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufsp2Q99K23 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufsp2Q99K23 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufsp2Q99K23 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufsp2Q99K23 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ufsp2Q99K23 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufsp2Q99K23 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufsp2Q99K23 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufsp2Q99K23 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufsp2Q99K23 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufsp2Q99K23 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufsp2Q99K23 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufsp2Q99K23 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufsp2Q99K23 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufsp2Q99K23 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufsp2Q99K23 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufsp2Q99K23 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufsp2Q99K23 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms