Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh2b1Q91ZM2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh2b1Q91ZM2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh2b1Q91ZM2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh2b1Q91ZM2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sh2b1Q91ZM2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh2b1Q91ZM2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh2b1Q91ZM2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh2b1Q91ZM2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh2b1Q91ZM2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh2b1Q91ZM2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh2b1Q91ZM2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh2b1Q91ZM2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh2b1Q91ZM2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sh2b1Q91ZM2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh2b1Q91ZM2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh2b1Q91ZM2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh2b1Q91ZM2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh2b1Q91ZM2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh2b1Q91ZM2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh2b1Q91ZM2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh2b1Q91ZM2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh2b1Q91ZM2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sh2b1Q91ZM2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sh2b1Q91ZM2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh2b1Q91ZM2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh2b1Q91ZM2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh2b1Q91ZM2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh2b1Q91ZM2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh2b1Q91ZM2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh2b1Q91ZM2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh2b1Q91ZM2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh2b1Q91ZM2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh2b1Q91ZM2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh2b1Q91ZM2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh2b1Q91ZM2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh2b1Q91ZM2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh2b1Q91ZM2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh2b1Q91ZM2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh2b1Q91ZM2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh2b1Q91ZM2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh2b1Q91ZM2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh2b1Q91ZM2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh2b1Q91ZM2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh2b1Q91ZM2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh2b1Q91ZM2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh2b1Q91ZM2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh2b1Q91ZM2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh2b1Q91ZM2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh2b1Q91ZM2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh2b1Q91ZM2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh2b1Q91ZM2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh2b1Q91ZM2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh2b1Q91ZM2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh2b1Q91ZM2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh2b1Q91ZM2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh2b1Q91ZM2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms