Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Atg13Q91YI1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Atg13Q91YI1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Atg13Q91YI1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Atg13Q91YI1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Atg13Q91YI1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Atg13Q91YI1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Atg13Q91YI1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Atg13Q91YI1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Atg13Q91YI1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Atg13Q91YI1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,96
Atg13Q91YI1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
Atg13Q91YI1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Atg13Q91YI1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Atg13Q91YI1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Atg13Q91YI1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Atg13Q91YI1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Atg13Q91YI1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Atg13Q91YI1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Atg13Q91YI1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Atg13Q91YI1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Atg13Q91YI1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Atg13Q91YI1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Atg13Q91YI1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Atg13Q91YI1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Atg13Q91YI1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Atg13Q91YI1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Atg13Q91YI1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Atg13Q91YI1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Atg13Q91YI1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Atg13Q91YI1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Atg13Q91YI1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Atg13Q91YI1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Atg13Q91YI1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Atg13Q91YI1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Atg13Q91YI1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Atg13Q91YI1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Atg13Q91YI1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Atg13Q91YI1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Atg13Q91YI1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Atg13Q91YI1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Atg13Q91YI1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Atg13Q91YI1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Atg13Q91YI1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
Atg13Q91YI1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Atg13Q91YI1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Atg13Q91YI1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Atg13Q91YI1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Atg13Q91YI1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Atg13Q91YI1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Atg13Q91YI1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Atg13Q91YI1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Atg13Q91YI1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Atg13Q91YI1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Atg13Q91YI1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Atg13Q91YI1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Atg13Q91YI1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Atg13Q91YI1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Atg13Q91YI1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Atg13Q91YI1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Atg13Q91YI1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Atg13Q91YI1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Atg13Q91YI1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Atg13Q91YI1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Atg13Q91YI1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Atg13Q91YI1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Atg13Q91YI1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Atg13Q91YI1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Atg13Q91YI1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Atg13Q91YI1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Atg13Q91YI1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Atg13Q91YI1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26,68■■□□□ 1,86
Atg13Q91YI1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Atg13Q91YI1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,7 ms