Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcdha5Q91Y15 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcdha5Q91Y15 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdha5Q91Y15 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdha5Q91Y15 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdha5Q91Y15 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdha5Q91Y15 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdha5Q91Y15 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdha5Q91Y15 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdha5Q91Y15 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdha5Q91Y15 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdha5Q91Y15 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdha5Q91Y15 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdha5Q91Y15 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcdha5Q91Y15 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdha5Q91Y15 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdha5Q91Y15 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdha5Q91Y15 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdha5Q91Y15 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdha5Q91Y15 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdha5Q91Y15 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdha5Q91Y15 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdha5Q91Y15 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdha5Q91Y15 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdha5Q91Y15 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdha5Q91Y15 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdha5Q91Y15 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcdha5Q91Y15 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdha5Q91Y15 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdha5Q91Y15 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdha5Q91Y15 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdha5Q91Y15 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdha5Q91Y15 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdha5Q91Y15 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdha5Q91Y15 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdha5Q91Y15 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdha5Q91Y15 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdha5Q91Y15 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdha5Q91Y15 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdha5Q91Y15 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pcdha5Q91Y15 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdha5Q91Y15 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdha5Q91Y15 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdha5Q91Y15 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdha5Q91Y15 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdha5Q91Y15 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdha5Q91Y15 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdha5Q91Y15 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdha5Q91Y15 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdha5Q91Y15 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdha5Q91Y15 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdha5Q91Y15 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdha5Q91Y15 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdha5Q91Y15 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdha5Q91Y15 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdha5Q91Y15 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdha5Q91Y15 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcdha5Q91Y15 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdha5Q91Y15 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdha5Q91Y15 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdha5Q91Y15 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdha5Q91Y15 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdha5Q91Y15 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdha5Q91Y15 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms