Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY5

Pcdhga3, Protocadherin gamma A3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga3Q91XY5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdhga3Q91XY5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhga3Q91XY5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhga3Q91XY5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhga3Q91XY5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhga3Q91XY5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhga3Q91XY5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhga3Q91XY5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhga3Q91XY5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhga3Q91XY5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhga3Q91XY5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhga3Q91XY5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdhga3Q91XY5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhga3Q91XY5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhga3Q91XY5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhga3Q91XY5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhga3Q91XY5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhga3Q91XY5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhga3Q91XY5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhga3Q91XY5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdhga3Q91XY5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdhga3Q91XY5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms