Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcoln3Q8R4F0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcoln3Q8R4F0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcoln3Q8R4F0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcoln3Q8R4F0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcoln3Q8R4F0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcoln3Q8R4F0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcoln3Q8R4F0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcoln3Q8R4F0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcoln3Q8R4F0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcoln3Q8R4F0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcoln3Q8R4F0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcoln3Q8R4F0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcoln3Q8R4F0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcoln3Q8R4F0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcoln3Q8R4F0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcoln3Q8R4F0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcoln3Q8R4F0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcoln3Q8R4F0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcoln3Q8R4F0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mcoln3Q8R4F0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcoln3Q8R4F0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcoln3Q8R4F0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcoln3Q8R4F0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcoln3Q8R4F0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcoln3Q8R4F0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcoln3Q8R4F0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcoln3Q8R4F0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcoln3Q8R4F0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcoln3Q8R4F0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcoln3Q8R4F0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcoln3Q8R4F0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcoln3Q8R4F0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcoln3Q8R4F0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcoln3Q8R4F0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcoln3Q8R4F0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcoln3Q8R4F0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcoln3Q8R4F0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcoln3Q8R4F0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcoln3Q8R4F0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mcoln3Q8R4F0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcoln3Q8R4F0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcoln3Q8R4F0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcoln3Q8R4F0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcoln3Q8R4F0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcoln3Q8R4F0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcoln3Q8R4F0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcoln3Q8R4F0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcoln3Q8R4F0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mcoln3Q8R4F0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mcoln3Q8R4F0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mcoln3Q8R4F0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms