Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps37bQ8R0J7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps37bQ8R0J7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps37bQ8R0J7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps37bQ8R0J7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps37bQ8R0J7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps37bQ8R0J7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps37bQ8R0J7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vps37bQ8R0J7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps37bQ8R0J7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps37bQ8R0J7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps37bQ8R0J7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps37bQ8R0J7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps37bQ8R0J7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps37bQ8R0J7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vps37bQ8R0J7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps37bQ8R0J7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps37bQ8R0J7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps37bQ8R0J7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps37bQ8R0J7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps37bQ8R0J7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps37bQ8R0J7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps37bQ8R0J7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps37bQ8R0J7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps37bQ8R0J7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps37bQ8R0J7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps37bQ8R0J7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps37bQ8R0J7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps37bQ8R0J7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps37bQ8R0J7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps37bQ8R0J7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps37bQ8R0J7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps37bQ8R0J7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps37bQ8R0J7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps37bQ8R0J7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps37bQ8R0J7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps37bQ8R0J7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps37bQ8R0J7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms