Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc5Q8K4Z2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc5Q8K4Z2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fndc5Q8K4Z2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc5Q8K4Z2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc5Q8K4Z2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc5Q8K4Z2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc5Q8K4Z2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc5Q8K4Z2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc5Q8K4Z2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc5Q8K4Z2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc5Q8K4Z2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc5Q8K4Z2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fndc5Q8K4Z2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc5Q8K4Z2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc5Q8K4Z2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc5Q8K4Z2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc5Q8K4Z2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc5Q8K4Z2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc5Q8K4Z2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc5Q8K4Z2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc5Q8K4Z2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc5Q8K4Z2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc5Q8K4Z2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc5Q8K4Z2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc5Q8K4Z2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc5Q8K4Z2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc5Q8K4Z2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc5Q8K4Z2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc5Q8K4Z2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc5Q8K4Z2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc5Q8K4Z2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms