Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S5

Klf11, Krueppel-like factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf11Q8K1S5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klf11Q8K1S5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klf11Q8K1S5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf11Q8K1S5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf11Q8K1S5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf11Q8K1S5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klf11Q8K1S5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf11Q8K1S5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf11Q8K1S5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klf11Q8K1S5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klf11Q8K1S5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Klf11Q8K1S5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klf11Q8K1S5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klf11Q8K1S5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf11Q8K1S5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf11Q8K1S5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klf11Q8K1S5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klf11Q8K1S5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klf11Q8K1S5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klf11Q8K1S5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms