Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI70

Lrrc20, Leucine-rich repeat-containing protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc20Q8CI70 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20,72■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20,71■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Lrrc20Q8CI70 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Lrrc20Q8CI70 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Lrrc20Q8CI70 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Lrrc20Q8CI70 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20,5■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Lrrc20Q8CI70 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20,4■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Lrrc20Q8CI70 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,85
Lrrc20Q8CI70 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Lrrc20Q8CI70 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Lrrc20Q8CI70 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Lrrc20Q8CI70 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Lrrc20Q8CI70 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Lrrc20Q8CI70 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Lrrc20Q8CI70 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Lrrc20Q8CI70 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Lrrc20Q8CI70 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms