Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4lQ8CFI0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd4lQ8CFI0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4lQ8CFI0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4lQ8CFI0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4lQ8CFI0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd4lQ8CFI0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd4lQ8CFI0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4lQ8CFI0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4lQ8CFI0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4lQ8CFI0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4lQ8CFI0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4lQ8CFI0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4lQ8CFI0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4lQ8CFI0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd4lQ8CFI0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4lQ8CFI0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4lQ8CFI0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd4lQ8CFI0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4lQ8CFI0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4lQ8CFI0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4lQ8CFI0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4lQ8CFI0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4lQ8CFI0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4lQ8CFI0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4lQ8CFI0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd4lQ8CFI0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd4lQ8CFI0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4lQ8CFI0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4lQ8CFI0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms