Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Pm20d1Q8C165 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Pm20d1Q8C165 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Pm20d1Q8C165 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Pm20d1Q8C165 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Pm20d1Q8C165 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Pm20d1Q8C165 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,98■■■■□ 3,03
Pm20d1Q8C165 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Pm20d1Q8C165 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,03
Pm20d1Q8C165 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Pm20d1Q8C165 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Pm20d1Q8C165 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Pm20d1Q8C165 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Pm20d1Q8C165 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Pm20d1Q8C165 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Pm20d1Q8C165 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Pm20d1Q8C165 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Pm20d1Q8C165 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Pm20d1Q8C165 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Pm20d1Q8C165 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Pm20d1Q8C165 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Pm20d1Q8C165 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,8■■■■□ 3
Pm20d1Q8C165 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Pm20d1Q8C165 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Pm20d1Q8C165 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33,69■■■□□ 2,98
Pm20d1Q8C165 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Pm20d1Q8C165 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Pm20d1Q8C165 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Pm20d1Q8C165 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Pm20d1Q8C165 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Pm20d1Q8C165 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Pm20d1Q8C165 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Pm20d1Q8C165 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Pm20d1Q8C165 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Pm20d1Q8C165 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Pm20d1Q8C165 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Pm20d1Q8C165 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Pm20d1Q8C165 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Pm20d1Q8C165 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Pm20d1Q8C165 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Pm20d1Q8C165 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Pm20d1Q8C165 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Pm20d1Q8C165 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Pm20d1Q8C165 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
Pm20d1Q8C165 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33,51■■■□□ 2,96
Pm20d1Q8C165 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Pm20d1Q8C165 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Pm20d1Q8C165 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33,51■■■□□ 2,95
Pm20d1Q8C165 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Pm20d1Q8C165 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Pm20d1Q8C165 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Pm20d1Q8C165 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Pm20d1Q8C165 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Pm20d1Q8C165 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Pm20d1Q8C165 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Pm20d1Q8C165 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Pm20d1Q8C165 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Pm20d1Q8C165 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Pm20d1Q8C165 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Pm20d1Q8C165 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Pm20d1Q8C165 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Pm20d1Q8C165 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Pm20d1Q8C165 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Pm20d1Q8C165 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Pm20d1Q8C165 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33,38■■■□□ 2,93
Pm20d1Q8C165 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Pm20d1Q8C165 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Pm20d1Q8C165 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Pm20d1Q8C165 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Pm20d1Q8C165 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Pm20d1Q8C165 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Pm20d1Q8C165 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Pm20d1Q8C165 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Pm20d1Q8C165 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Pm20d1Q8C165 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Pm20d1Q8C165 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Pm20d1Q8C165 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Pm20d1Q8C165 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Pm20d1Q8C165 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Pm20d1Q8C165 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Pm20d1Q8C165 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Pm20d1Q8C165 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Pm20d1Q8C165 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Pm20d1Q8C165 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Pm20d1Q8C165 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Pm20d1Q8C165 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Pm20d1Q8C165 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Pm20d1Q8C165 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33,22■■■□□ 2,91
Pm20d1Q8C165 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,6 ms