Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps13cQ8BX70 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps13cQ8BX70 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps13cQ8BX70 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps13cQ8BX70 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps13cQ8BX70 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps13cQ8BX70 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps13cQ8BX70 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps13cQ8BX70 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps13cQ8BX70 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps13cQ8BX70 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps13cQ8BX70 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps13cQ8BX70 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps13cQ8BX70 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps13cQ8BX70 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps13cQ8BX70 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps13cQ8BX70 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps13cQ8BX70 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps13cQ8BX70 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps13cQ8BX70 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps13cQ8BX70 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps13cQ8BX70 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps13cQ8BX70 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps13cQ8BX70 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps13cQ8BX70 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps13cQ8BX70 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps13cQ8BX70 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps13cQ8BX70 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Vps13cQ8BX70 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps13cQ8BX70 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps13cQ8BX70 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps13cQ8BX70 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps13cQ8BX70 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps13cQ8BX70 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps13cQ8BX70 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps13cQ8BX70 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps13cQ8BX70 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps13cQ8BX70 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps13cQ8BX70 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps13cQ8BX70 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps13cQ8BX70 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps13cQ8BX70 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps13cQ8BX70 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps13cQ8BX70 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps13cQ8BX70 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps13cQ8BX70 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps13cQ8BX70 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps13cQ8BX70 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps13cQ8BX70 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps13cQ8BX70 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps13cQ8BX70 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps13cQ8BX70 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps13cQ8BX70 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps13cQ8BX70 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps13cQ8BX70 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps13cQ8BX70 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps13cQ8BX70 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps13cQ8BX70 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Vps13cQ8BX70 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps13cQ8BX70 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps13cQ8BX70 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps13cQ8BX70 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps13cQ8BX70 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps13cQ8BX70 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps13cQ8BX70 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps13cQ8BX70 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps13cQ8BX70 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps13cQ8BX70 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps13cQ8BX70 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps13cQ8BX70 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps13cQ8BX70 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps13cQ8BX70 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps13cQ8BX70 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps13cQ8BX70 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps13cQ8BX70 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms