Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smad3Q8BUN5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smad3Q8BUN5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smad3Q8BUN5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smad3Q8BUN5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smad3Q8BUN5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smad3Q8BUN5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smad3Q8BUN5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smad3Q8BUN5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smad3Q8BUN5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smad3Q8BUN5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smad3Q8BUN5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smad3Q8BUN5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smad3Q8BUN5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smad3Q8BUN5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smad3Q8BUN5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smad3Q8BUN5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smad3Q8BUN5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smad3Q8BUN5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Smad3Q8BUN5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Smad3Q8BUN5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smad3Q8BUN5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smad3Q8BUN5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smad3Q8BUN5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Smad3Q8BUN5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smad3Q8BUN5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Smad3Q8BUN5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smad3Q8BUN5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smad3Q8BUN5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smad3Q8BUN5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Smad3Q8BUN5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smad3Q8BUN5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smad3Q8BUN5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smad3Q8BUN5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smad3Q8BUN5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smad3Q8BUN5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Smad3Q8BUN5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smad3Q8BUN5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smad3Q8BUN5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smad3Q8BUN5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smad3Q8BUN5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smad3Q8BUN5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smad3Q8BUN5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Smad3Q8BUN5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Smad3Q8BUN5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smad3Q8BUN5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smad3Q8BUN5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smad3Q8BUN5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Smad3Q8BUN5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smad3Q8BUN5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smad3Q8BUN5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smad3Q8BUN5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smad3Q8BUN5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Smad3Q8BUN5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smad3Q8BUN5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smad3Q8BUN5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smad3Q8BUN5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smad3Q8BUN5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smad3Q8BUN5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smad3Q8BUN5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smad3Q8BUN5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smad3Q8BUN5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smad3Q8BUN5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smad3Q8BUN5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smad3Q8BUN5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smad3Q8BUN5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smad3Q8BUN5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smad3Q8BUN5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smad3Q8BUN5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smad3Q8BUN5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smad3Q8BUN5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smad3Q8BUN5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms