Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Suds3Q8BR65 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Suds3Q8BR65 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Suds3Q8BR65 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Suds3Q8BR65 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Suds3Q8BR65 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Suds3Q8BR65 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Suds3Q8BR65 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Suds3Q8BR65 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Suds3Q8BR65 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Suds3Q8BR65 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Suds3Q8BR65 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Suds3Q8BR65 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Suds3Q8BR65 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Suds3Q8BR65 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Suds3Q8BR65 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Suds3Q8BR65 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Suds3Q8BR65 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Suds3Q8BR65 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Suds3Q8BR65 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Suds3Q8BR65 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Suds3Q8BR65 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Suds3Q8BR65 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Suds3Q8BR65 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Suds3Q8BR65 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Suds3Q8BR65 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Suds3Q8BR65 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Suds3Q8BR65 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Suds3Q8BR65 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Suds3Q8BR65 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Suds3Q8BR65 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Suds3Q8BR65 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Suds3Q8BR65 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Suds3Q8BR65 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Suds3Q8BR65 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Suds3Q8BR65 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Suds3Q8BR65 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Suds3Q8BR65 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Suds3Q8BR65 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Suds3Q8BR65 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Suds3Q8BR65 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Suds3Q8BR65 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Suds3Q8BR65 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Suds3Q8BR65 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Suds3Q8BR65 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Suds3Q8BR65 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Suds3Q8BR65 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Suds3Q8BR65 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Suds3Q8BR65 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Suds3Q8BR65 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Suds3Q8BR65 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Suds3Q8BR65 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Suds3Q8BR65 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Suds3Q8BR65 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Suds3Q8BR65 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Suds3Q8BR65 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Suds3Q8BR65 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Suds3Q8BR65 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms