Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ckap4Q8BMK4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ckap4Q8BMK4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ckap4Q8BMK4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ckap4Q8BMK4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap4Q8BMK4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap4Q8BMK4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap4Q8BMK4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap4Q8BMK4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap4Q8BMK4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap4Q8BMK4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap4Q8BMK4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ckap4Q8BMK4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap4Q8BMK4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap4Q8BMK4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap4Q8BMK4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap4Q8BMK4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap4Q8BMK4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap4Q8BMK4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap4Q8BMK4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ckap4Q8BMK4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ckap4Q8BMK4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ckap4Q8BMK4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ckap4Q8BMK4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ckap4Q8BMK4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ckap4Q8BMK4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ckap4Q8BMK4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ckap4Q8BMK4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ckap4Q8BMK4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ckap4Q8BMK4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ckap4Q8BMK4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ckap4Q8BMK4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ckap4Q8BMK4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckap4Q8BMK4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ckap4Q8BMK4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ckap4Q8BMK4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckap4Q8BMK4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ckap4Q8BMK4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap4Q8BMK4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap4Q8BMK4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap4Q8BMK4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ckap4Q8BMK4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ckap4Q8BMK4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ckap4Q8BMK4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ckap4Q8BMK4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckap4Q8BMK4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ckap4Q8BMK4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ckap4Q8BMK4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ckap4Q8BMK4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap4Q8BMK4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap4Q8BMK4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ckap4Q8BMK4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ckap4Q8BMK4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap4Q8BMK4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ckap4Q8BMK4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ckap4Q8BMK4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap4Q8BMK4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap4Q8BMK4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap4Q8BMK4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap4Q8BMK4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap4Q8BMK4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap4Q8BMK4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap4Q8BMK4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms