Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rspo4Q8BJ73 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rspo4Q8BJ73 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rspo4Q8BJ73 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rspo4Q8BJ73 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rspo4Q8BJ73 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rspo4Q8BJ73 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rspo4Q8BJ73 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rspo4Q8BJ73 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rspo4Q8BJ73 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rspo4Q8BJ73 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rspo4Q8BJ73 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rspo4Q8BJ73 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rspo4Q8BJ73 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rspo4Q8BJ73 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rspo4Q8BJ73 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rspo4Q8BJ73 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rspo4Q8BJ73 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rspo4Q8BJ73 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rspo4Q8BJ73 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rspo4Q8BJ73 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rspo4Q8BJ73 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rspo4Q8BJ73 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rspo4Q8BJ73 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rspo4Q8BJ73 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rspo4Q8BJ73 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rspo4Q8BJ73 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rspo4Q8BJ73 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rspo4Q8BJ73 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rspo4Q8BJ73 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rspo4Q8BJ73 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rspo4Q8BJ73 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rspo4Q8BJ73 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rspo4Q8BJ73 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rspo4Q8BJ73 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rspo4Q8BJ73 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rspo4Q8BJ73 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rspo4Q8BJ73 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rspo4Q8BJ73 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rspo4Q8BJ73 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rspo4Q8BJ73 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rspo4Q8BJ73 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rspo4Q8BJ73 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rspo4Q8BJ73 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rspo4Q8BJ73 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rspo4Q8BJ73 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rspo4Q8BJ73 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rspo4Q8BJ73 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rspo4Q8BJ73 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rspo4Q8BJ73 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rspo4Q8BJ73 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rspo4Q8BJ73 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rspo4Q8BJ73 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rspo4Q8BJ73 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rspo4Q8BJ73 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rspo4Q8BJ73 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rspo4Q8BJ73 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rspo4Q8BJ73 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms