Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHF7

Pgs1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgs1Q8BHF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pgs1Q8BHF7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pgs1Q8BHF7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pgs1Q8BHF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pgs1Q8BHF7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pgs1Q8BHF7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pgs1Q8BHF7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pgs1Q8BHF7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pgs1Q8BHF7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pgs1Q8BHF7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pgs1Q8BHF7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pgs1Q8BHF7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pgs1Q8BHF7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pgs1Q8BHF7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pgs1Q8BHF7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pgs1Q8BHF7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pgs1Q8BHF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pgs1Q8BHF7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pgs1Q8BHF7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pgs1Q8BHF7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pgs1Q8BHF7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pgs1Q8BHF7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgs1Q8BHF7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pgs1Q8BHF7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgs1Q8BHF7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pgs1Q8BHF7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pgs1Q8BHF7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pgs1Q8BHF7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgs1Q8BHF7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgs1Q8BHF7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgs1Q8BHF7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgs1Q8BHF7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgs1Q8BHF7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pgs1Q8BHF7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pgs1Q8BHF7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pgs1Q8BHF7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pgs1Q8BHF7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pgs1Q8BHF7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgs1Q8BHF7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgs1Q8BHF7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgs1Q8BHF7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pgs1Q8BHF7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pgs1Q8BHF7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pgs1Q8BHF7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pgs1Q8BHF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pgs1Q8BHF7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms