Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zer1Q80ZJ6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zer1Q80ZJ6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zer1Q80ZJ6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zer1Q80ZJ6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zer1Q80ZJ6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zer1Q80ZJ6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zer1Q80ZJ6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zer1Q80ZJ6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zer1Q80ZJ6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zer1Q80ZJ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zer1Q80ZJ6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zer1Q80ZJ6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zer1Q80ZJ6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zer1Q80ZJ6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zer1Q80ZJ6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zer1Q80ZJ6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zer1Q80ZJ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zer1Q80ZJ6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zer1Q80ZJ6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zer1Q80ZJ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zer1Q80ZJ6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zer1Q80ZJ6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms