Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,33■■■■■ 4,21
AknaQ80VW7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC41,32■■■■■ 4,21
AknaQ80VW7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,3■■■■■ 4,2
AknaQ80VW7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
AknaQ80VW7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41,21■■■■■ 4,19
AknaQ80VW7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,21■■■■■ 4,19
AknaQ80VW7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,21■■■■■ 4,19
AknaQ80VW7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
AknaQ80VW7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,18■■■■■ 4,18
AknaQ80VW7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41,16■■■■■ 4,18
AknaQ80VW7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41,15■■■■■ 4,18
AknaQ80VW7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41,13■■■■■ 4,17
AknaQ80VW7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
AknaQ80VW7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41,11■■■■■ 4,17
AknaQ80VW7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC41,09■■■■■ 4,17
AknaQ80VW7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,16
AknaQ80VW7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC41,06■■■■■ 4,16
AknaQ80VW7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41,05■■■■■ 4,16
AknaQ80VW7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,04■■■■■ 4,16
AknaQ80VW7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41,04■■■■■ 4,16
AknaQ80VW7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
AknaQ80VW7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,03■■■■■ 4,16
AknaQ80VW7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
AknaQ80VW7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4,15
AknaQ80VW7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
AknaQ80VW7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40,98■■■■■ 4,15
AknaQ80VW7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40,95■■■■■ 4,15
AknaQ80VW7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
AknaQ80VW7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
AknaQ80VW7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
AknaQ80VW7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
AknaQ80VW7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40,88■■■■■ 4,13
AknaQ80VW7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
AknaQ80VW7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
AknaQ80VW7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
AknaQ80VW7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40,84■■■■■ 4,13
AknaQ80VW7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,83■■■■■ 4,13
AknaQ80VW7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40,83■■■■■ 4,13
AknaQ80VW7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40,82■■■■■ 4,12
AknaQ80VW7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
AknaQ80VW7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,11
AknaQ80VW7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
AknaQ80VW7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40,73■■■■■ 4,11
AknaQ80VW7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
AknaQ80VW7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40,72■■■■■ 4,11
AknaQ80VW7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,71■■■■■ 4,11
AknaQ80VW7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
AknaQ80VW7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,69■■■■■ 4,1
AknaQ80VW7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
AknaQ80VW7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
AknaQ80VW7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40,68■■■■■ 4,1
AknaQ80VW7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
AknaQ80VW7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
AknaQ80VW7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
AknaQ80VW7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
AknaQ80VW7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40,65■■■■■ 4,1
AknaQ80VW7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,64■■■■■ 4,1
AknaQ80VW7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
AknaQ80VW7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
AknaQ80VW7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40,62■■■■■ 4,09
AknaQ80VW7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40,62■■■■■ 4,09
AknaQ80VW7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
AknaQ80VW7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40,6■■■■■ 4,09
AknaQ80VW7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
AknaQ80VW7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
AknaQ80VW7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
AknaQ80VW7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,56■■■■■ 4,08
AknaQ80VW7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
AknaQ80VW7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40,52■■■■■ 4,08
AknaQ80VW7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
AknaQ80VW7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
AknaQ80VW7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
AknaQ80VW7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40,49■■■■■ 4,07
AknaQ80VW7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
AknaQ80VW7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40,47■■■■■ 4,07
AknaQ80VW7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
AknaQ80VW7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40,45■■■■■ 4,07
AknaQ80VW7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
AknaQ80VW7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
AknaQ80VW7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40,44■■■■■ 4,06
AknaQ80VW7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40,43■■■■■ 4,06
AknaQ80VW7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
AknaQ80VW7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40,42■■■■■ 4,06
AknaQ80VW7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
AknaQ80VW7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40,42■■■■■ 4,06
AknaQ80VW7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
AknaQ80VW7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
AknaQ80VW7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
AknaQ80VW7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40,39■■■■■ 4,06
AknaQ80VW7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40,38■■■■■ 4,05
AknaQ80VW7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40,38■■■■■ 4,05
AknaQ80VW7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
AknaQ80VW7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
AknaQ80VW7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40,31■■■■■ 4,04
AknaQ80VW7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40,3■■■■■ 4,04
AknaQ80VW7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
AknaQ80VW7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
AknaQ80VW7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
AknaQ80VW7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
AknaQ80VW7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms