Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
AknaQ80VW7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
AknaQ80VW7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
AknaQ80VW7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
AknaQ80VW7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
AknaQ80VW7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
AknaQ80VW7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
AknaQ80VW7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
AknaQ80VW7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
AknaQ80VW7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
AknaQ80VW7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
AknaQ80VW7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
AknaQ80VW7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
AknaQ80VW7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
AknaQ80VW7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
AknaQ80VW7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
AknaQ80VW7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
AknaQ80VW7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
AknaQ80VW7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
AknaQ80VW7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
AknaQ80VW7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
AknaQ80VW7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
AknaQ80VW7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
AknaQ80VW7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
AknaQ80VW7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
AknaQ80VW7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
AknaQ80VW7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
AknaQ80VW7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
AknaQ80VW7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
AknaQ80VW7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
AknaQ80VW7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
AknaQ80VW7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
AknaQ80VW7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
AknaQ80VW7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
AknaQ80VW7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
AknaQ80VW7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
AknaQ80VW7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
AknaQ80VW7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
AknaQ80VW7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
AknaQ80VW7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
AknaQ80VW7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
AknaQ80VW7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
AknaQ80VW7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
AknaQ80VW7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
AknaQ80VW7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
AknaQ80VW7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
AknaQ80VW7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
AknaQ80VW7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
AknaQ80VW7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
AknaQ80VW7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
AknaQ80VW7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
AknaQ80VW7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
AknaQ80VW7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
AknaQ80VW7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
AknaQ80VW7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
AknaQ80VW7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
AknaQ80VW7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
AknaQ80VW7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
AknaQ80VW7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
AknaQ80VW7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
AknaQ80VW7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
AknaQ80VW7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
AknaQ80VW7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
AknaQ80VW7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
AknaQ80VW7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
AknaQ80VW7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
AknaQ80VW7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
AknaQ80VW7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
AknaQ80VW7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
AknaQ80VW7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
AknaQ80VW7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
AknaQ80VW7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
AknaQ80VW7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
AknaQ80VW7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
AknaQ80VW7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
AknaQ80VW7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
AknaQ80VW7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
AknaQ80VW7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
AknaQ80VW7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
AknaQ80VW7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
AknaQ80VW7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
AknaQ80VW7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
AknaQ80VW7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
AknaQ80VW7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
AknaQ80VW7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
AknaQ80VW7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
AknaQ80VW7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
AknaQ80VW7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
AknaQ80VW7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
AknaQ80VW7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
AknaQ80VW7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
AknaQ80VW7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
AknaQ80VW7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
AknaQ80VW7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
AknaQ80VW7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
AknaQ80VW7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
AknaQ80VW7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
AknaQ80VW7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
AknaQ80VW7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
AknaQ80VW7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms