Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
Rusc2Q80U22 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.39
Rusc2Q80U22 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Rusc2Q80U22 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Rusc2Q80U22 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Rusc2Q80U22 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Rusc2Q80U22 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Rusc2Q80U22 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Rusc2Q80U22 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Rusc2Q80U22 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Rusc2Q80U22 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.36
Rusc2Q80U22 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Rusc2Q80U22 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Rusc2Q80U22 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Rusc2Q80U22 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Rusc2Q80U22 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Rusc2Q80U22 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
Rusc2Q80U22 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Rusc2Q80U22 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Rusc2Q80U22 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Rusc2Q80U22 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
Rusc2Q80U22 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rusc2Q80U22 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Rusc2Q80U22 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Rusc2Q80U22 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Rusc2Q80U22 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
Rusc2Q80U22 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Rusc2Q80U22 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Rusc2Q80U22 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Rusc2Q80U22 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rusc2Q80U22 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rusc2Q80U22 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Rusc2Q80U22 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rusc2Q80U22 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
Rusc2Q80U22 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Rusc2Q80U22 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Rusc2Q80U22 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Rusc2Q80U22 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Rusc2Q80U22 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Rusc2Q80U22 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rusc2Q80U22 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
Rusc2Q80U22 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Rusc2Q80U22 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rusc2Q80U22 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rusc2Q80U22 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Rusc2Q80U22 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Rusc2Q80U22 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Rusc2Q80U22 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Rusc2Q80U22 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Rusc2Q80U22 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Rusc2Q80U22 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Rusc2Q80U22 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Rusc2Q80U22 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Rusc2Q80U22 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rusc2Q80U22 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rusc2Q80U22 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Rusc2Q80U22 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Rusc2Q80U22 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Rusc2Q80U22 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
Rusc2Q80U22 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rusc2Q80U22 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Rusc2Q80U22 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
Rusc2Q80U22 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Rusc2Q80U22 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rusc2Q80U22 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Rusc2Q80U22 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rusc2Q80U22 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Rusc2Q80U22 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Rusc2Q80U22 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rusc2Q80U22 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Rusc2Q80U22 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rusc2Q80U22 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rusc2Q80U22 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rusc2Q80U22 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rusc2Q80U22 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rusc2Q80U22 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rusc2Q80U22 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rusc2Q80U22 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rusc2Q80U22 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rusc2Q80U22 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Rusc2Q80U22 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Rusc2Q80U22 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Rusc2Q80U22 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Rusc2Q80U22 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rusc2Q80U22 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rusc2Q80U22 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Rusc2Q80U22 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
Rusc2Q80U22 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rusc2Q80U22 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms