Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Tmc8Q7TN58 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Tmc8Q7TN58 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Tmc8Q7TN58 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Tmc8Q7TN58 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Tmc8Q7TN58 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tmc8Q7TN58 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Tmc8Q7TN58 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Tmc8Q7TN58 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Tmc8Q7TN58 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Tmc8Q7TN58 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Tmc8Q7TN58 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tmc8Q7TN58 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tmc8Q7TN58 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tmc8Q7TN58 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Tmc8Q7TN58 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tmc8Q7TN58 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tmc8Q7TN58 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Tmc8Q7TN58 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Tmc8Q7TN58 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Tmc8Q7TN58 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Tmc8Q7TN58 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Tmc8Q7TN58 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Tmc8Q7TN58 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Tmc8Q7TN58 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
Tmc8Q7TN58 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Tmc8Q7TN58 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Tmc8Q7TN58 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tmc8Q7TN58 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tmc8Q7TN58 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Tmc8Q7TN58 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tmc8Q7TN58 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Tmc8Q7TN58 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Tmc8Q7TN58 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Tmc8Q7TN58 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Tmc8Q7TN58 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Tmc8Q7TN58 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tmc8Q7TN58 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tmc8Q7TN58 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Tmc8Q7TN58 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Tmc8Q7TN58 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Tmc8Q7TN58 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Tmc8Q7TN58 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Tmc8Q7TN58 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Tmc8Q7TN58 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Tmc8Q7TN58 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Tmc8Q7TN58 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Tmc8Q7TN58 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Tmc8Q7TN58 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Tmc8Q7TN58 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Tmc8Q7TN58 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Tmc8Q7TN58 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Tmc8Q7TN58 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Tmc8Q7TN58 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Tmc8Q7TN58 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Tmc8Q7TN58 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Tmc8Q7TN58 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Tmc8Q7TN58 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Tmc8Q7TN58 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Tmc8Q7TN58 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,8 ms