Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-M2Q6W9L1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M2Q6W9L1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-M2Q6W9L1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-M2Q6W9L1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-M2Q6W9L1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-M2Q6W9L1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-M2Q6W9L1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-M2Q6W9L1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M2Q6W9L1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M2Q6W9L1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M2Q6W9L1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M2Q6W9L1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M2Q6W9L1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M2Q6W9L1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M2Q6W9L1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms