Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Fgd6Q69ZL1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Fgd6Q69ZL1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
Fgd6Q69ZL1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Fgd6Q69ZL1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Fgd6Q69ZL1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Fgd6Q69ZL1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Fgd6Q69ZL1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Fgd6Q69ZL1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Fgd6Q69ZL1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Fgd6Q69ZL1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Fgd6Q69ZL1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Fgd6Q69ZL1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Fgd6Q69ZL1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Fgd6Q69ZL1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
Fgd6Q69ZL1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Fgd6Q69ZL1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Fgd6Q69ZL1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Fgd6Q69ZL1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Fgd6Q69ZL1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Fgd6Q69ZL1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Fgd6Q69ZL1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Fgd6Q69ZL1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Fgd6Q69ZL1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Fgd6Q69ZL1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Fgd6Q69ZL1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Fgd6Q69ZL1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Fgd6Q69ZL1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Fgd6Q69ZL1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Fgd6Q69ZL1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Fgd6Q69ZL1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Fgd6Q69ZL1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Fgd6Q69ZL1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Fgd6Q69ZL1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Fgd6Q69ZL1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Fgd6Q69ZL1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
Fgd6Q69ZL1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Fgd6Q69ZL1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Fgd6Q69ZL1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Fgd6Q69ZL1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Fgd6Q69ZL1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Fgd6Q69ZL1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Fgd6Q69ZL1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Fgd6Q69ZL1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Fgd6Q69ZL1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Fgd6Q69ZL1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Fgd6Q69ZL1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Fgd6Q69ZL1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Fgd6Q69ZL1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Fgd6Q69ZL1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Fgd6Q69ZL1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Fgd6Q69ZL1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Fgd6Q69ZL1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Fgd6Q69ZL1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Fgd6Q69ZL1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Fgd6Q69ZL1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
Fgd6Q69ZL1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Fgd6Q69ZL1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Fgd6Q69ZL1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Fgd6Q69ZL1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Fgd6Q69ZL1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Fgd6Q69ZL1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Fgd6Q69ZL1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Fgd6Q69ZL1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Fgd6Q69ZL1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Fgd6Q69ZL1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Fgd6Q69ZL1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Fgd6Q69ZL1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Fgd6Q69ZL1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Fgd6Q69ZL1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Fgd6Q69ZL1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Fgd6Q69ZL1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Fgd6Q69ZL1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Fgd6Q69ZL1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Fgd6Q69ZL1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Fgd6Q69ZL1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
Fgd6Q69ZL1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
Fgd6Q69ZL1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Fgd6Q69ZL1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Fgd6Q69ZL1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Fgd6Q69ZL1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Fgd6Q69ZL1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Fgd6Q69ZL1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Fgd6Q69ZL1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Fgd6Q69ZL1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Fgd6Q69ZL1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Fgd6Q69ZL1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Fgd6Q69ZL1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Fgd6Q69ZL1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Fgd6Q69ZL1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Fgd6Q69ZL1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Fgd6Q69ZL1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Fgd6Q69ZL1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Fgd6Q69ZL1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Fgd6Q69ZL1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Fgd6Q69ZL1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Fgd6Q69ZL1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Fgd6Q69ZL1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Fgd6Q69ZL1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms