Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf280dQ68FE8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf280dQ68FE8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf280dQ68FE8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf280dQ68FE8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf280dQ68FE8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf280dQ68FE8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf280dQ68FE8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf280dQ68FE8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf280dQ68FE8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf280dQ68FE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf280dQ68FE8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf280dQ68FE8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf280dQ68FE8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf280dQ68FE8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf280dQ68FE8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf280dQ68FE8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf280dQ68FE8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf280dQ68FE8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf280dQ68FE8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf280dQ68FE8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf280dQ68FE8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf280dQ68FE8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf280dQ68FE8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf280dQ68FE8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf280dQ68FE8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf280dQ68FE8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf280dQ68FE8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf280dQ68FE8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf280dQ68FE8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf280dQ68FE8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf280dQ68FE8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf280dQ68FE8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf280dQ68FE8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf280dQ68FE8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf280dQ68FE8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf280dQ68FE8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf280dQ68FE8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf280dQ68FE8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf280dQ68FE8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf280dQ68FE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf280dQ68FE8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf280dQ68FE8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf280dQ68FE8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf280dQ68FE8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf280dQ68FE8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf280dQ68FE8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Znf280dQ68FE8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf280dQ68FE8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf280dQ68FE8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf280dQ68FE8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf280dQ68FE8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf280dQ68FE8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf280dQ68FE8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf280dQ68FE8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf280dQ68FE8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf280dQ68FE8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf280dQ68FE8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf280dQ68FE8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf280dQ68FE8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf280dQ68FE8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf280dQ68FE8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf280dQ68FE8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf280dQ68FE8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Znf280dQ68FE8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf280dQ68FE8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf280dQ68FE8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf280dQ68FE8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf280dQ68FE8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf280dQ68FE8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf280dQ68FE8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf280dQ68FE8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf280dQ68FE8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf280dQ68FE8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf280dQ68FE8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms