Protein–RNA interactions for Protein: Q64523

Hist2h2ac, Histone H2A type 2-C, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2acQ64523 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hist2h2acQ64523 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hist2h2acQ64523 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hist2h2acQ64523 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hist2h2acQ64523 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hist2h2acQ64523 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hist2h2acQ64523 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hist2h2acQ64523 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hist2h2acQ64523 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hist2h2acQ64523 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hist2h2acQ64523 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hist2h2acQ64523 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hist2h2acQ64523 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hist2h2acQ64523 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hist2h2acQ64523 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hist2h2acQ64523 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hist2h2acQ64523 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hist2h2acQ64523 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hist2h2acQ64523 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hist2h2acQ64523 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hist2h2acQ64523 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hist2h2acQ64523 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hist2h2acQ64523 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hist2h2acQ64523 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hist2h2acQ64523 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hist2h2acQ64523 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2acQ64523 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hist2h2acQ64523 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms