Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps72Q62481 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps72Q62481 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps72Q62481 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps72Q62481 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps72Q62481 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps72Q62481 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vps72Q62481 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Vps72Q62481 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Vps72Q62481 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps72Q62481 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps72Q62481 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps72Q62481 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps72Q62481 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps72Q62481 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps72Q62481 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps72Q62481 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps72Q62481 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps72Q62481 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vps72Q62481 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps72Q62481 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps72Q62481 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps72Q62481 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps72Q62481 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps72Q62481 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps72Q62481 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps72Q62481 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps72Q62481 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps72Q62481 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps72Q62481 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps72Q62481 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps72Q62481 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps72Q62481 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps72Q62481 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps72Q62481 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps72Q62481 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps72Q62481 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps72Q62481 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps72Q62481 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps72Q62481 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps72Q62481 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps72Q62481 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps72Q62481 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps72Q62481 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps72Q62481 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps72Q62481 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps72Q62481 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps72Q62481 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps72Q62481 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps72Q62481 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps72Q62481 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps72Q62481 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vps72Q62481 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vps72Q62481 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps72Q62481 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps72Q62481 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Vps72Q62481 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vps72Q62481 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vps72Q62481 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps72Q62481 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps72Q62481 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps72Q62481 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps72Q62481 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps72Q62481 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps72Q62481 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps72Q62481 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps72Q62481 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps72Q62481 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps72Q62481 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps72Q62481 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps72Q62481 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps72Q62481 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps72Q62481 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps72Q62481 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps72Q62481 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps72Q62481 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps72Q62481 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps72Q62481 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps72Q62481 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps72Q62481 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps72Q62481 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps72Q62481 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps72Q62481 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps72Q62481 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps72Q62481 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Vps72Q62481 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps72Q62481 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps72Q62481 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms