Protein–RNA interactions for Protein: Q61704

Itih3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih3Q61704 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itih3Q61704 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itih3Q61704 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itih3Q61704 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itih3Q61704 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itih3Q61704 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itih3Q61704 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itih3Q61704 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itih3Q61704 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itih3Q61704 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itih3Q61704 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itih3Q61704 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itih3Q61704 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itih3Q61704 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itih3Q61704 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itih3Q61704 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itih3Q61704 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itih3Q61704 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itih3Q61704 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itih3Q61704 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itih3Q61704 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itih3Q61704 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itih3Q61704 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itih3Q61704 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itih3Q61704 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itih3Q61704 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itih3Q61704 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itih3Q61704 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itih3Q61704 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itih3Q61704 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itih3Q61704 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itih3Q61704 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itih3Q61704 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itih3Q61704 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Itih3Q61704 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Itih3Q61704 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itih3Q61704 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itih3Q61704 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itih3Q61704 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Itih3Q61704 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itih3Q61704 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itih3Q61704 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itih3Q61704 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itih3Q61704 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itih3Q61704 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itih3Q61704 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itih3Q61704 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itih3Q61704 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itih3Q61704 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itih3Q61704 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itih3Q61704 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itih3Q61704 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itih3Q61704 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itih3Q61704 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itih3Q61704 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itih3Q61704 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Itih3Q61704 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itih3Q61704 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itih3Q61704 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itih3Q61704 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itih3Q61704 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itih3Q61704 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itih3Q61704 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itih3Q61704 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Itih3Q61704 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itih3Q61704 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itih3Q61704 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itih3Q61704 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itih3Q61704 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itih3Q61704 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itih3Q61704 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms