Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DbpQ60925 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DbpQ60925 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DbpQ60925 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DbpQ60925 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DbpQ60925 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DbpQ60925 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DbpQ60925 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DbpQ60925 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DbpQ60925 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DbpQ60925 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DbpQ60925 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DbpQ60925 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DbpQ60925 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DbpQ60925 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DbpQ60925 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DbpQ60925 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DbpQ60925 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DbpQ60925 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DbpQ60925 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DbpQ60925 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DbpQ60925 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DbpQ60925 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DbpQ60925 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DbpQ60925 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DbpQ60925 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DbpQ60925 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DbpQ60925 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DbpQ60925 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DbpQ60925 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DbpQ60925 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DbpQ60925 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DbpQ60925 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DbpQ60925 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DbpQ60925 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DbpQ60925 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DbpQ60925 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DbpQ60925 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DbpQ60925 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DbpQ60925 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DbpQ60925 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DbpQ60925 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DbpQ60925 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DbpQ60925 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DbpQ60925 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DbpQ60925 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms