Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ChukQ60680 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ChukQ60680 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ChukQ60680 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChukQ60680 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChukQ60680 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChukQ60680 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChukQ60680 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChukQ60680 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChukQ60680 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ChukQ60680 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ChukQ60680 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChukQ60680 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ChukQ60680 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChukQ60680 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ChukQ60680 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ChukQ60680 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ChukQ60680 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ChukQ60680 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ChukQ60680 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ChukQ60680 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ChukQ60680 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ChukQ60680 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ChukQ60680 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ChukQ60680 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChukQ60680 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChukQ60680 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChukQ60680 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChukQ60680 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChukQ60680 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ChukQ60680 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChukQ60680 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChukQ60680 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChukQ60680 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ChukQ60680 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ChukQ60680 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChukQ60680 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChukQ60680 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ChukQ60680 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChukQ60680 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChukQ60680 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChukQ60680 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ChukQ60680 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ChukQ60680 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ChukQ60680 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChukQ60680 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ChukQ60680 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms