Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ccdc88aQ5SNZ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ccdc88aQ5SNZ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Ccdc88aQ5SNZ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ccdc88aQ5SNZ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ccdc88aQ5SNZ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ccdc88aQ5SNZ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Ccdc88aQ5SNZ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,37
Ccdc88aQ5SNZ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Ccdc88aQ5SNZ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Ccdc88aQ5SNZ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ccdc88aQ5SNZ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ccdc88aQ5SNZ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ccdc88aQ5SNZ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ccdc88aQ5SNZ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ccdc88aQ5SNZ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ccdc88aQ5SNZ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ccdc88aQ5SNZ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ccdc88aQ5SNZ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ccdc88aQ5SNZ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ccdc88aQ5SNZ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
Ccdc88aQ5SNZ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ccdc88aQ5SNZ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ccdc88aQ5SNZ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ccdc88aQ5SNZ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Ccdc88aQ5SNZ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ccdc88aQ5SNZ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ccdc88aQ5SNZ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ccdc88aQ5SNZ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ccdc88aQ5SNZ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ccdc88aQ5SNZ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ccdc88aQ5SNZ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ccdc88aQ5SNZ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ccdc88aQ5SNZ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Ccdc88aQ5SNZ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Ccdc88aQ5SNZ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ccdc88aQ5SNZ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ccdc88aQ5SNZ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ccdc88aQ5SNZ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ccdc88aQ5SNZ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ccdc88aQ5SNZ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ccdc88aQ5SNZ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms