Protein–RNA interactions for Protein: Q5G866

Defa23, Alpha-defensin 23, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa23Q5G866 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa23Q5G866 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa23Q5G866 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa23Q5G866 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa23Q5G866 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa23Q5G866 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa23Q5G866 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa23Q5G866 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa23Q5G866 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa23Q5G866 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa23Q5G866 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa23Q5G866 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa23Q5G866 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa23Q5G866 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa23Q5G866 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa23Q5G866 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa23Q5G866 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa23Q5G866 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms