Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam208bQ5DTT3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam208bQ5DTT3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam208bQ5DTT3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam208bQ5DTT3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam208bQ5DTT3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam208bQ5DTT3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam208bQ5DTT3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam208bQ5DTT3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam208bQ5DTT3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam208bQ5DTT3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam208bQ5DTT3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam208bQ5DTT3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam208bQ5DTT3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam208bQ5DTT3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam208bQ5DTT3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam208bQ5DTT3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam208bQ5DTT3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam208bQ5DTT3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam208bQ5DTT3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam208bQ5DTT3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam208bQ5DTT3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam208bQ5DTT3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam208bQ5DTT3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam208bQ5DTT3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam208bQ5DTT3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam208bQ5DTT3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam208bQ5DTT3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam208bQ5DTT3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam208bQ5DTT3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam208bQ5DTT3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam208bQ5DTT3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam208bQ5DTT3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam208bQ5DTT3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam208bQ5DTT3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam208bQ5DTT3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam208bQ5DTT3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam208bQ5DTT3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam208bQ5DTT3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam208bQ5DTT3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam208bQ5DTT3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam208bQ5DTT3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam208bQ5DTT3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam208bQ5DTT3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam208bQ5DTT3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam208bQ5DTT3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam208bQ5DTT3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam208bQ5DTT3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam208bQ5DTT3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam208bQ5DTT3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam208bQ5DTT3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam208bQ5DTT3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam208bQ5DTT3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam208bQ5DTT3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam208bQ5DTT3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam208bQ5DTT3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam208bQ5DTT3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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